燕云十六声的墓穴没有统一的入口点位，游戏内分布开封悬河之墟、隐雾之狱、罪之回廊、秦川狮子坟、江南蟒滩口墓穴等多处独立墓穴秘境，每一处墓穴都拥有专属的传送点位、前置触发条件与开启机关，玩家需要按照对应墓穴的要求解锁入口，才能够顺利进入地下墓室开展探索。
开封区域墓穴是玩家接触最多的墓穴副本，悬河之墟需要先传送至九流门驻地，朝左后方远处山体方位前进，找到墓穴入口与对应NPC对话触发前置任务，搭乘电梯向下，完成初期对话之后等待地板塌陷，即可正式进入墓穴深处；隐雾之狱则要传送至隐雾林传送点，回头找到隐雾之牢洞口，对话时选择直面恐惧选项解锁地下区域；罪之回廊位置在开封禁中诸库，先把游戏内时间切换到子时，进入内侧院落右侧房间，与房间当中的发光镜子交互，就能够传送进入墓穴空间，三处墓穴入口都不需要额外道具，只需要完成对话与场景交互即可开启。
秦川狮子坟墓穴开启流程相对复杂，先要完成残章我的朋友相关剧情，救出文墨深之后前往芥子庐，将场景时间调至西时找到齐思贤，随后前往狮子坟区域，击杀四处刷新的风滚草收集绣球，将绣球放置在四座空置的石狮子口中，中央大石狮的嘴巴就会缓缓打开，露出通往地下墓穴的洞口。江南蟒滩口墓穴的进入方式更加简单，切换至夜晚时段前往蟒滩口标记点位，直接与地面摆放的棺材进行交互，就可以进入墓穴，不需要完成冗长的前置任务。
墓穴探索还有不少容易忽略的细节，进入墓穴之前建议提前备好对应的武学与轻功，悬河之墟最好提前装备九重春色伞类武学，方便跨越复杂地形。墓穴内部遍布尖刺陷阱、迷雾区域、巡逻怪物，大量隐藏宝箱藏在房梁、夹层、水下洞窟当中，玩家要记得第一时间解锁沿途界碑，避免迷路之后需要从头跑图。部分墓穴内存在无法击杀的精英怪，遇到红色高亮的强敌不需要硬抗，绕开路线快速通过即可，不要浪费输出资源。如果进入墓穴之后中途退出，再次进入时只需要找到原入口交互，不用重复完成全部前置任务，已经解锁的界碑可以直接传送，大幅节省往返时间。
